Les champs d'action de l'Institut pasteur du Maroc se définissent comme suit :

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Promouvoir et développer la recherche scientifique
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Contribuer à l'enseignement des disciplines biologiques liées à ces activités
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Préparer ou importer des sérums, vaccins, ferments et produits biologiques nécessaires aux besoins du pays en ce qui concerne la médecine humaine
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Apporter sur des bases contractuelles une contribution d'expertise, d'analyses et conseil à tout individu, à toute entreprise, administration et autre institution régionale, nationale ou internationale