مجلس اداري
يتولى إدارة مركز الأمصال واللقاحات مجلس إدارة برئاسة وزير الصحة والحماية الاجتماعية أو من ينوب عنه
المشورة الفنية والعلمية
تم إنشاء لجنة إدارة المعهد في 11 يوليو 2019، وتتمثل مهمة لجنة إدارة المعهد في مساعدة الإدارة في إدارة شؤون المعهد
لجنة إدارة CSV
يرأس مدير CTS ويتكون من 4 أعضاء بحكم مناصبهم: ممثل عن المصالح الفنية بوزارة الصحة والحماية الاجتماعية.