تتحدد مجالات عمل معهد باستور المغربي على النحو التالي :

  • تعزيز وتطوير البحث العلمي

  • المساهمة في تدريس التخصصات البيولوجية المتعلقة بهذه الأنشطة

  • إعداد أو استيراد الأمصال واللقاحات والمتخمرات والمنتجات البيولوجية اللازمة لاحتياجات البلاد في مجال الطب البشري

  • تقديم، على أساس تعاقدي، مساهمة بالخبرة والتحليل والمشورة لأي فرد وأي شركة أو إدارة أو مؤسسة إقليمية أو وطنية أو دولية أخرى